Cytoscape是一款圖形化顯示網絡并進行分析和編輯的軟件，支持多種網絡描述格式，也可以用以Tab制表符分隔的文本文檔或Microsoft Excel文件作為輸入，或者利用Cytoscape軟件本身的編輯器模塊直接構建網絡，操作方式便捷。

相關軟件推薦

相關軟件	版本說明	下載地址
生物無憂	醫學視頻播放軟件	查看
MEGA進化樹	分子進化遺傳分析軟件	查看
醫學文獻王	一款功能強大的醫學書籍查看軟件	查看
云譯通生物醫藥版	生物翻譯	查看

功能介紹:

      1、支持多種分析方式，可以選擇分析網絡。

      2、支持分析節點的子集、批次分析、加載網絡統計信息

      3、繪制參數、從統計信息生成樣式

      4、使用可擴展對話框界面顯示網絡統計信息

      5、在節點表中存儲節點參數、在邊緣表中存儲邊緣參數

      6、明亮的顏色映射標準 ameters、暗色映射標準 ameters、中間顏色映射標準 ameters

      7、NetworkAnalyzer、Cytoscape 網絡瀏覽器

      8、合并流程、作業狀態監視器、命令行對話框、執行命令文件

      9、選定的節點、帶有選項的選定節點、命令行參數

      10、Cytoscape 的快速游覽、創建網絡、嵌套網絡

      11、支持的網絡文件格式、節點和邊列數據

      12、風格、應用程序管理器、命令工具、渲染引擎、導出數據

      13、Cytoscape 和 OpenCL、Cytoscape.js 和Cytoscape 自動化

Cytoscape軟件特色

      Cytoscape使用可縮放的用戶界面來導航和查看網絡。ZUIs使用兩種導航機制:縮放和平移。縮放根據用戶想要看到的內容的多少或多少來增加或減少視圖的放大

      節點和邊緣列數據

      交互網絡作為獨立的模型是有用的。然而，當與其他信息結合在一起時，它們對于回答科學問題是最有效的。Cytoscape允許用戶將任意節點、邊緣和網絡信息作為節點/邊緣/網絡數據列添加到Cytoscape中

      Cytoscape功能不是固定的。它們可以通過應用程序擴展。它們可以以各種方式擴展細Cytoscape。一個應用程序可以從在線數據庫導入數據。另一個應用程序可以提供一種分析網絡的新方法。你可以在安裝了Cytoscape之后安裝應用程序。大多數應用程序都是像你這樣的Cytoscape用戶開發的。

      如果你熟悉Cytoscape2。你可能知道細Cytoscape應用程序被稱為插件。從Cytoscape3.0開始，我們稱之為應用。

使用方法

      Abs -返回一個數字的絕對值。

      ACos -返回一個數字的反余弦值。

      反正弦-返回一個數字的反正弦值。

      返回兩個數字x和y的反正切。

      平均值——返回一組數字的平均值。

      Cos -返回弧度中給定的角的余弦值。

      返回其參數的雙曲正弦值。

      計數——返回列表中數字值的數量。

      度——返回其參數從弧度轉換為度。

      Exp -返回提高到指定數字的e。

      Ln -返回一個數字的自然對數。

      Log -返回一個數字到指定基數的對數。

      Max -返回一組數字的最大值。

      中位數——返回數字列表的中位數。

      最小值——返回一組數字的最小值。

      Mod -計算一個數字的模量。

      返回p值的近似值。

      弧度-返回從度轉換為弧度的參數。

      將一個數字四舍五入到指定的小數位數。

      Sin -返回以弧度表示的角的正弦值。

      Sinh -返回其參數的雙曲正弦。

      根號——計算一個數字的平方根。

      Tan -返回其參數的Tan值。

      Tanh -返回其參數在弧度內的雙曲正切。

      Trunc -截斷一個數字。

      字符串函數

      連接-連接兩個或多個文本。

      Left -返回一個s字符串的前綴。

      Len -返回字符串的長度。

      將一個字符串轉換為小寫字母。

      選擇某個文本的子字符串。

      返回字符串的后綴。

      替換——用其他文本替換某些文本。

      文本——使用Java DecimalFormat類的約定來格式化數字。

      將字符串轉換為大寫。

      值——將字符串轉換為數字。

      邏輯/布爾函數

      返回任意數量布爾值的邏輯連接。

      Not -返回布爾值的邏輯否定。

      返回任意數量布爾值的邏輯分離。

      列表功能

      First -返回列表中的第一個條目。

      最后-返回列表中的最后一個條目。

      返回列表中的第n項。

      統計功能

      最大-列表中第k個最大的值。

      土地族——一組數字的幾何平均值。

      HarMean——一組數字的調和平均值。

      模式——一組數字的模式。

      返回正態分布的pdf或CDF。

      Permut——返回給定數量的對象的排列數。

      標準偏差樣本。

      Var -樣本方差。

      各種各樣的功能

      返回給定數量的對象的組合數。

      If -返回基于布爾值的兩個選項之一。

      返回列表的字符串表示形式。

      現在-返回當前日期和時間的字符串表示形式。

      返回當前日期的字符串表示形式。

用戶評論

      哪個服：

      操作挺簡單的，也比較好用

      部分：

      軟件挺不錯的，使用范圍也挺廣泛的